Охотск — одно из старейших русских поселений на Дальнем Востоке. В 1647 году казаками было основано зимовье, в 1716 году в Охотске было построено первое судно и Охотск стал портом, через который началось освоение побережья Дальнего Востока.

Для охраны побережий и островов Тихого океана, открытых русскими землепроходцами и мореплавателями, в Охотске создается база Сибирской военной флотилии. В 1732 году по инициативе Витуса Беринга создана «Охотская навигацкая школа». В 1783 году Охотск стал областным городом Иркутского наместничества. В 1796 году при императоре Павле I образуется Охотская область, в состав которой входят Камчатка, Чукотка и Охотоморское побережье. Областным центром определен город Охотск.

До первой половины XIX века Охотск — основной порт России на её восточных рубежах, колыбель отечественного тихоокеанского флота, с начала XVIII века — отправной пункт экспедиций, исследовавших северную часть Тихого океана и открывших западное побережье Северной Америки.

Период навигации в порту с мая по ноябрь. Имеется пять причалов общей протяженностью 552 метра. Максимальные габариты судов, заходящих в порт (осадка, длина, ширина) — 3,5/110/18 м. Проводится рейдовая выгрузка большегрузных судов.

На территории морского порта Охотск погрузо-разгрузочную деятельность осуществляет ООО «Охотский торговый порт».