Первые упоминания о местности, в которой в настоящее время расположен морской порт Александровск-Сахалинский, относятся к 1853 году, когда в районе мыса Дуэ (недалеко от Александровска) мореплаватель, геолог и гидрограф Римский-Корсаков заготавливал для своей шхуны «Восток» 15 тысяч пудов угля. В 1862 году неподалеку была построена слободка Александровка (в честь российского императора Александра II), а в 1881 году в слободке основывается военный пост. В 1885 году на месте нынешнего порта была построена пристань для швартовки судов и погрузки углём. С этой даты и начинается история порта Александровск-Сахалинский. В 1939 году в морском порту Александровск-Сахалинский был построен порт-ковш для укрытия портового флота, работающего на рейдовой обработке судов, а также для производства погрузочно-разгрузочных работ. В 1951 году постановлением Совета Министров СССР от 06.11.1951 № 4393-1972с морской порт Александровск-Сахалинский был открыт для международного сообщения. В период с 50-х по 90-е годы морской порт Александровск-Сахалинский являлся одним из самых крупных предприятий города Александровск. Через морской порт производился завоз снабжения из морского порта Ванино на северную часть острова Сахалин в районы Александровский, Тымовский и Ногликский. В структуре грузовой базы был представлен весь ассортимент продуктов питания, различные виды генгрузов, нефтепродукты. На экспорт через морской порт осуществлялась отгрузка леса, металлолома и угля.
В августе 2021 года распоряжением Правительства России от 17.08.2021 № 2245-р принято решение о закрытии морского порта Александровск-Сахалинский для оказания услуг и захода иностранных судов. В сентябре 2021 года постановлением Правительства России от 22.09.2021 № 1599 пункт пропуска через государственную границу Российской Федерации в морском порту Александровск-Сахалинский исключен из перечня пунктов пропуска через государственную границу Российской Федерации. Перспективы развития морского порта Александровск-Сахалинский связаны с разработкой угольных месторождений, а также с развитием лесопереработки на территории Александровск-Сахалинского района острова Сахалин.
