Общая протяженность причалов торгового порта — 1450 м. Производится погрузка, разгрузка и обслуживание российских и иностранных судов и автомобильного транспорта, включая агентирование судов.

Хранение грузов в торговом порту осуществляется в крытых складах и открытых складских площадках общей площадью соответственно 10,6 тыс.кв.м и 6,6 тыс. кв.м. В порту перерабатываются генеральные, лесные, минерально-строительные грузы, уголь, контейнеры. Для переработки грузов имеется 11 портальных кранов г/п от 5 до 20 тонн, автокран, 3 плавкрана г/п от 5 до 16 тонн, 18 автопогрузчиков г/п от 1 до 10 тонн.
Николаевск-на-Амуре связан регулярными рейсами с городами Хабаровск, Охотск, Комсомольск-на-Амуре, Благовещенск.