На севере границей между Северо-Курильским городским округом и Камчатской областью служит Первый Курильский пролив между островом Шумшу и Камчатским полуостровом.
На юге Северо-Курильский городской округ граничит с Курильским городским округом, линией раздела служит пролив Дианы между островами Кетой и Симушир.
Наибольшим по площади является остров Парамушир (2042 кв. км.). Его горные хребты (Вернадского и Карпинского) состоят из цепочек вулканов, из которых активны Эбеко (на севере) и Чикурачки (на юге), а также ряд более мелких вулканов, как Фусса и Карпинского.
Острова Северо-Курильского городского округа образуют северное звено островов Курильской гряды.
Северные острова Курильской гряды характеризуются распространением зарослей кедрового стланика, ольховника, рябины бузинолистной и почти полным отсутствием лесов. По поймам рек произрастают ивы разных видов.
Территория Северо-Курильского городского округа обладает природными и историческими ресурсами для развития туристической деятельности – экстремальной, научно-познавательной, военно-исторической. Оптимальное время для туристического сезона – август – сентябрь. В настоящее время туризм не относится к значимым секторам в экономике района. Этому способствуют объективные причины (в основном, природно-климатические).
Северо-Курильский городской округ характеризуется чрезвычайно сложными условиями для хозяйственного освоения, обусловленными высокой сейсмической активностью района, активной вулканической деятельностью (Вулкан Эбеко представляет реальную опасность для населения и инфраструктуры города Северо-Курильска, так как город расположен в зоне катастрофической опасности от вулкана – ближе 9 км.), цунами опасностью. Значительная часть территории неблагоприятна для хозяйственного освоения по условиям рельефа – вулканические хребты и горные массивы характеризуются большими уклонами поверхности, интенсивной расчлененностью, широким развитием экзогенных процессов – селей, лавин, обвалов, осыпей и т.д.
Морской терминал Северо-Курильск расположен в Северо-Курильском заливе острова Парамушир, второго Курильского пролива, соединяющего Охотское море и Тихий океан. В последние годы расширение возможностей портовой инфраструктуры Курильских островов отмечено активным государственным участием. Часть инфраструктурных объектов уже построена за счет инвесторов в рамках преференциального режима ТОР и программы квот под инвестиции. Например, в Северо-Курильске.
После передачи морского терминала Северо-Курильск в ведение ФГУП «Нацрыбресурс» предприятием предприняты меры по улучшению условий для рыбопромыслового флота. Так, промысловые суда имеют право на внеочередное обслуживание, отсрочки оплаты и скидки.
Морской терминал Северо-Курильск состоит из пяти гидротехнических сооружений общей протяженностью 889 погонных метров. За год через них переваливается порядка 80 тыс. тонн рыбопродукции, 5-6 тыс. тонн дизельного топлива, 10 тыс. тонн генеральных грузов.
На территории терминала Северо-Курильск обслуживаются и работают более 60 судов.