Судоходство в порту Ванино осуществляется в гидрометеорологических условиях, характеризующихся густыми туманами в весенний и летний периоды, сильными штормовыми ветрами в осенний и зимний периоды, дрейфующим льдом в зимний период.
Навигация в порту осуществляется круглогодично.
Порт осуществляет работу круглосуточно и имеет грузовой постоянный многосторонний пункт пропуска через государственную границу Российской Федерации.
В порту осуществляется буксирное обеспечение судов.
С началом льдообразования осуществляется ледокольная проводка судов в соответствии с требованиями Общих правил плавания и Обязательных постановлений в морском порту Ванино.
В границах морского порта Ванино осуществляют свою деятельность различные хозяйствующие субъекты (стивидорные, агентирующие, бункеровочные). Основными предприятиями, эксплуатирующими причальный фронт различного назначения, являются:
АО «Порт Ванино» — крупнейшая стивидорная компания Ванинского транспортного узла, осуществляющая перевалку грузов самой широкой номенклатуры. Принимает к обработке суда длинной до 200 метров и максимальной осадкой — 10,2 м. Объем перевалки грузов в 2017 году составил 7,2 млн тонн. К 2020 году увеличены терминальные мощности до 16,4 млн тонн в год.
АО «Дальтрансуголь» — современный угольный терминал, способный принимать суда водоизмещением до 170 тысяч тонн и максимальной осадкой 17,0 метров. Объем перевалки угля в 2017 году составил 19,4 млн тонн. В 2020 году АО «Дальтрансуголь» стал перерабатывать 30 млн тонн угля в год.
ООО «Трансбункер-Ванино» осуществляет перевалку темных и светлых нефтепродуктов. Способно принимать суда водоизмещением до 120 тысяч тонн при максимальной осадке 13,5 метра. Объем перевалки грузов в 2017 году составил 2,4 млн тонн.
В настоящее время в бухте Мучке АО «ВаниноТрансУголь» ведется строительство еще одного из крупнейших угольных терминалов Дальнего Востока — транспортно-перегрузочного комплекса для перегрузки угля и железорудного концентрата.
