Компания осуществляет морские и речные перевозки внутри России и за рубежом. В число ключевых направлений деятельности входит транспортировка грузов по Северному морскому пути в районы Крайнего Севера. Судами компании доставляется топливо, продовольственные и промышленные товары, механизмы, оборудование и автотранспорт. Маршруты международных перевозок включают в себя бассейны Средиземного и Черного морей, морей Западной Европы, а также Дальнего Востока.
В структуру компании входит опорный пункт базирования флота для работы на малых глубинах — порт Хатанга. Он находится в самом центре Северного морского пути, что позволяет максимально эффективно осуществлять рейдовые выгрузки собственного крупнотоннажного флота и дальнейшую доставку в пункты назначения с малыми глубинами, по рекам и на необорудованный берег. ХМТП играет важную роль в освоении минеральных ресурсов арктической зоны и континентального шельфа Российской Федерации, а также в программах северного завоза.
