Оператор бункеровочного бизнеса «Газпром нефти» — «Газпромнефть Марин Бункер» осуществляет бункеровку в 37 портах: во всех основных российских, а также за рубежом в портах Констанца (Румыния), Рига (Латвия) и Таллин (Эстония). В 2019 году объем премиальных продаж бункерного топлива компании составил 3 млн тонн.
В числе клиентов «Газпромнефть Марин Бункера» — крупные российские и иностранные судоходные компании. Собственный флот компании насчитывает 10 судов-бункеровщиков.
Обеспечение гарантированных поставок судового топлива для арктических проектов «Газпром нефти» — стратегическая задача «Газпромнефть Марин Бункера».
Для ее решения создана необходимая бункерная инфраструктура, приспособленная к условиям крайнего севера. В настоящее время бункеровка судов в портах Мурманска и Архангельска осуществляется судном-бункеровщиком арктического класса.